La gloria no acabaría aquí ya que llegaría la Eurocopa del 2000, y al clasificarse, pasarían de fase de grupos. Llegaría la gran final ante los italianos, camiseta de francia a la que vencieron en un gol de oro marcado por Trezeguet. Más tarde, en Hong Kong, marcó su segundo gol de cabeza. Al finalizar la temporada, Henry fue seleccionado entre los finalistas para el premio al Jugador Más Valioso de la temporada de la MLS, pero el galardón finalmente fue para Chris Wondolowski.
